Das Schengen Museum sowie die angeschlossene Tourist-Information werden von der Vereinigung Centre Européen Schengen a.s.b.l. betrieben, die im Jahr 2004 mit dem Ziel gegründet wurde, den Tourismus in der Region zu fördern und die Bedeutung des Schengener Abkommens erlebbar zu machen. Nach 15 erfolgreichen Jahren und mit großzügiger Unterstützung der Gemeinde Schengen sowie des luxemburgischen Wirtschaftsministeriums wurde das Museum in den Jahren 2024/2025 umfassend modernisiert. Anlässlich des 40. Jahrestages der Unterzeichnung des Schengener Abkommens wurde es am 14. Juni 2025 feierlich wiedereröffnet. Das historische Schiff, auf dem das Abkommen seinerzeit unterschrieben wurde, bildet seither unter dem Namen Prinzessin Marie-Astrid Europa einen Teil der Ausstellung und liegt in unmittelbarer Nähe an der Mosel. Im Laufe der Jahre hat sich das Museum zu einem anerkannten Dokumentations- und Bildungszentrum entwickelt. Durch seine Aktivitäten fördert es den Dialog, den Austausch sowie die internationale Zusammenarbeit.